Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Phf11bB4XVQ1 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Phf11bB4XVQ1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Phf11bB4XVQ1 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Phf11bB4XVQ1 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Phf11bB4XVQ1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Phf11bB4XVQ1 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Phf11bB4XVQ1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms