Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Gm6133B2RY53 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm6133B2RY53 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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