Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
PtprbB2RU80 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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