Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
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Prrt4B2RU40 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Prrt4B2RU40 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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