Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brpf1B2RRD7 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms