Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Scn3aA2ASI5 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Scn3aA2ASI5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Scn3aA2ASI5 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Scn3aA2ASI5 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Scn3aA2ASI5 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Scn3aA2ASI5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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