Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SktA2AQ25 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms