Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtf1A2AQ19 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Rtf1A2AQ19 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Rtf1A2AQ19 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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Rtf1A2AQ19 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtf1A2AQ19 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms