Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Syndig1A2ANU3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Syndig1A2ANU3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms