Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Ccdc163A2AGD7 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc163A2AGD7 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms