Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
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