Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdfS4R2K0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PdfS4R2K0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PdfS4R2K0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PdfS4R2K0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PdfS4R2K0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdfS4R2K0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdfS4R2K0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdfS4R2K0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdfS4R2K0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdfS4R2K0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdfS4R2K0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdfS4R2K0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdfS4R2K0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdfS4R2K0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdfS4R2K0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdfS4R2K0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms