Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm26992S4R1A3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm26992S4R1A3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm26992S4R1A3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm26992S4R1A3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm26992S4R1A3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm26992S4R1A3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm26992S4R1A3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm26992S4R1A3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm26992S4R1A3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm26992S4R1A3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm26992S4R1A3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm26992S4R1A3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm26992S4R1A3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms