Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z331

Krt6b, Keratin, type II cytoskeletal 6B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6bQ9Z331 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt6bQ9Z331 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Krt6bQ9Z331 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms