Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Ubl3Q9Z2M6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ubl3Q9Z2M6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms