Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2J0

Slc23a1, Solute carrier family 23 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc23a1Q9Z2J0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc23a1Q9Z2J0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc23a1Q9Z2J0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc23a1Q9Z2J0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc23a1Q9Z2J0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc23a1Q9Z2J0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc23a1Q9Z2J0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms