Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mbd3Q9Z2D8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mbd3Q9Z2D8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mbd3Q9Z2D8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mbd3Q9Z2D8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mbd3Q9Z2D8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mbd3Q9Z2D8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mbd3Q9Z2D8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mbd3Q9Z2D8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mbd3Q9Z2D8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mbd3Q9Z2D8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mbd3Q9Z2D8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mbd3Q9Z2D8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mbd3Q9Z2D8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mbd3Q9Z2D8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mbd3Q9Z2D8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mbd3Q9Z2D8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mbd3Q9Z2D8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mbd3Q9Z2D8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mbd3Q9Z2D8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mbd3Q9Z2D8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mbd3Q9Z2D8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mbd3Q9Z2D8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mbd3Q9Z2D8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mbd3Q9Z2D8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mbd3Q9Z2D8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mbd3Q9Z2D8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mbd3Q9Z2D8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mbd3Q9Z2D8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mbd3Q9Z2D8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mbd3Q9Z2D8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mbd3Q9Z2D8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mbd3Q9Z2D8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms