Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Cldn8Q9Z260 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn8Q9Z260 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn8Q9Z260 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms