Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cacna2d3Q9Z1L5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms