Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y9

Nr1h3, Oxysterols receptor LXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h3Q9Z0Y9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nr1h3Q9Z0Y9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr1h3Q9Z0Y9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr1h3Q9Z0Y9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr1h3Q9Z0Y9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms