Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0J7

Gdf15, Growth/differentiation factor 15, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf15Q9Z0J7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gdf15Q9Z0J7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gdf15Q9Z0J7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdf15Q9Z0J7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdf15Q9Z0J7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdf15Q9Z0J7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdf15Q9Z0J7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdf15Q9Z0J7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gdf15Q9Z0J7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms