Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp2Q9Z0E6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbp2Q9Z0E6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp2Q9Z0E6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp2Q9Z0E6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp2Q9Z0E6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp2Q9Z0E6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp2Q9Z0E6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbp2Q9Z0E6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp2Q9Z0E6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp2Q9Z0E6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp2Q9Z0E6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp2Q9Z0E6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp2Q9Z0E6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp2Q9Z0E6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp2Q9Z0E6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp2Q9Z0E6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp2Q9Z0E6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbp2Q9Z0E6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp2Q9Z0E6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp2Q9Z0E6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp2Q9Z0E6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbp2Q9Z0E6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gbp2Q9Z0E6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp2Q9Z0E6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms