Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVK8

Cyp46a1, Cholesterol 24-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp46a1Q9WVK8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyp46a1Q9WVK8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyp46a1Q9WVK8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyp46a1Q9WVK8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyp46a1Q9WVK8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyp46a1Q9WVK8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyp46a1Q9WVK8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyp46a1Q9WVK8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyp46a1Q9WVK8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyp46a1Q9WVK8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyp46a1Q9WVK8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyp46a1Q9WVK8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cyp46a1Q9WVK8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cyp46a1Q9WVK8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cyp46a1Q9WVK8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cyp46a1Q9WVK8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cyp46a1Q9WVK8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cyp46a1Q9WVK8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cyp46a1Q9WVK8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyp46a1Q9WVK8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyp46a1Q9WVK8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyp46a1Q9WVK8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyp46a1Q9WVK8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyp46a1Q9WVK8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyp46a1Q9WVK8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyp46a1Q9WVK8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cyp46a1Q9WVK8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyp46a1Q9WVK8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cyp46a1Q9WVK8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cyp46a1Q9WVK8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cyp46a1Q9WVK8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp46a1Q9WVK8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp46a1Q9WVK8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp46a1Q9WVK8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyp46a1Q9WVK8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp46a1Q9WVK8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp46a1Q9WVK8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp46a1Q9WVK8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp46a1Q9WVK8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyp46a1Q9WVK8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp46a1Q9WVK8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp46a1Q9WVK8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp46a1Q9WVK8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp46a1Q9WVK8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp46a1Q9WVK8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cyp46a1Q9WVK8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp46a1Q9WVK8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp46a1Q9WVK8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp46a1Q9WVK8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp46a1Q9WVK8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyp46a1Q9WVK8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp46a1Q9WVK8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp46a1Q9WVK8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp46a1Q9WVK8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp46a1Q9WVK8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp46a1Q9WVK8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyp46a1Q9WVK8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms