Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Clcn5Q9WVD4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clcn5Q9WVD4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms