Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP7

Uchl5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L5, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl5Q9WUP7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Uchl5Q9WUP7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Uchl5Q9WUP7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Uchl5Q9WUP7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms