Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Opn3Q9WUK7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn3Q9WUK7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms