Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK4

Rfc2, Replication factor C subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc2Q9WUK4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfc2Q9WUK4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfc2Q9WUK4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfc2Q9WUK4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rfc2Q9WUK4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rfc2Q9WUK4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfc2Q9WUK4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfc2Q9WUK4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfc2Q9WUK4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfc2Q9WUK4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfc2Q9WUK4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfc2Q9WUK4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfc2Q9WUK4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfc2Q9WUK4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfc2Q9WUK4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfc2Q9WUK4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rfc2Q9WUK4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfc2Q9WUK4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rfc2Q9WUK4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rfc2Q9WUK4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rfc2Q9WUK4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms