Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUF2

Egr4, Early growth response protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr4Q9WUF2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Egr4Q9WUF2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Egr4Q9WUF2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Egr4Q9WUF2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Egr4Q9WUF2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Egr4Q9WUF2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Egr4Q9WUF2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Egr4Q9WUF2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Egr4Q9WUF2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Egr4Q9WUF2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Egr4Q9WUF2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Egr4Q9WUF2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Egr4Q9WUF2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Egr4Q9WUF2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Egr4Q9WUF2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Egr4Q9WUF2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Egr4Q9WUF2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Egr4Q9WUF2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Egr4Q9WUF2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Egr4Q9WUF2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Egr4Q9WUF2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Egr4Q9WUF2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Egr4Q9WUF2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Egr4Q9WUF2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Egr4Q9WUF2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Egr4Q9WUF2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Egr4Q9WUF2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Egr4Q9WUF2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Egr4Q9WUF2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Egr4Q9WUF2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Egr4Q9WUF2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Egr4Q9WUF2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Egr4Q9WUF2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egr4Q9WUF2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egr4Q9WUF2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egr4Q9WUF2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egr4Q9WUF2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egr4Q9WUF2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egr4Q9WUF2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Egr4Q9WUF2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egr4Q9WUF2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egr4Q9WUF2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Egr4Q9WUF2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Egr4Q9WUF2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Egr4Q9WUF2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms