Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scnn1bQ9WU38 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scnn1bQ9WU38 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scnn1bQ9WU38 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms