Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PplQ9R269 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PplQ9R269 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PplQ9R269 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PplQ9R269 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PplQ9R269 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PplQ9R269 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PplQ9R269 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PplQ9R269 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PplQ9R269 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PplQ9R269 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PplQ9R269 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PplQ9R269 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PplQ9R269 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PplQ9R269 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PplQ9R269 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PplQ9R269 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PplQ9R269 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
PplQ9R269 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PplQ9R269 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PplQ9R269 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PplQ9R269 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PplQ9R269 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PplQ9R269 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PplQ9R269 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PplQ9R269 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PplQ9R269 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PplQ9R269 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
PplQ9R269 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PplQ9R269 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PplQ9R269 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PplQ9R269 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PplQ9R269 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PplQ9R269 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PplQ9R269 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PplQ9R269 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PplQ9R269 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PplQ9R269 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PplQ9R269 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PplQ9R269 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PplQ9R269 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PplQ9R269 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PplQ9R269 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PplQ9R269 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PplQ9R269 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PplQ9R269 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PplQ9R269 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PplQ9R269 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PplQ9R269 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PplQ9R269 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PplQ9R269 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PplQ9R269 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PplQ9R269 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PplQ9R269 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PplQ9R269 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PplQ9R269 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PplQ9R269 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PplQ9R269 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PplQ9R269 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PplQ9R269 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PplQ9R269 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PplQ9R269 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PplQ9R269 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PplQ9R269 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PplQ9R269 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PplQ9R269 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PplQ9R269 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PplQ9R269 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PplQ9R269 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PplQ9R269 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PplQ9R269 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PplQ9R269 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PplQ9R269 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PplQ9R269 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PplQ9R269 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PplQ9R269 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PplQ9R269 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PplQ9R269 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PplQ9R269 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PplQ9R269 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PplQ9R269 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PplQ9R269 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PplQ9R269 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PplQ9R269 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PplQ9R269 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PplQ9R269 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PplQ9R269 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PplQ9R269 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PplQ9R269 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PplQ9R269 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PplQ9R269 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PplQ9R269 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PplQ9R269 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PplQ9R269 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PplQ9R269 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PplQ9R269 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PplQ9R269 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PplQ9R269 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PplQ9R269 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PplQ9R269 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms