Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1W3

Rnf103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf103Q9R1W3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf103Q9R1W3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf103Q9R1W3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf103Q9R1W3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf103Q9R1W3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf103Q9R1W3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf103Q9R1W3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf103Q9R1W3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf103Q9R1W3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf103Q9R1W3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf103Q9R1W3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf103Q9R1W3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf103Q9R1W3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf103Q9R1W3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf103Q9R1W3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf103Q9R1W3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf103Q9R1W3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf103Q9R1W3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf103Q9R1W3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf103Q9R1W3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf103Q9R1W3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf103Q9R1W3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf103Q9R1W3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf103Q9R1W3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf103Q9R1W3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf103Q9R1W3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rnf103Q9R1W3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf103Q9R1W3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf103Q9R1W3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf103Q9R1W3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf103Q9R1W3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf103Q9R1W3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf103Q9R1W3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf103Q9R1W3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf103Q9R1W3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf103Q9R1W3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf103Q9R1W3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf103Q9R1W3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf103Q9R1W3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf103Q9R1W3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf103Q9R1W3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf103Q9R1W3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf103Q9R1W3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf103Q9R1W3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf103Q9R1W3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf103Q9R1W3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf103Q9R1W3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf103Q9R1W3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf103Q9R1W3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf103Q9R1W3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf103Q9R1W3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf103Q9R1W3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf103Q9R1W3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf103Q9R1W3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 244.3 ms