Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1S7

Abcc6, Multidrug resistance-associated protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc6Q9R1S7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Abcc6Q9R1S7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Abcc6Q9R1S7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Abcc6Q9R1S7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Abcc6Q9R1S7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Abcc6Q9R1S7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Abcc6Q9R1S7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Abcc6Q9R1S7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Abcc6Q9R1S7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Abcc6Q9R1S7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Abcc6Q9R1S7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Abcc6Q9R1S7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Abcc6Q9R1S7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Abcc6Q9R1S7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Abcc6Q9R1S7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Abcc6Q9R1S7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Abcc6Q9R1S7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Abcc6Q9R1S7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Abcc6Q9R1S7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Abcc6Q9R1S7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Abcc6Q9R1S7 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Abcc6Q9R1S7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Abcc6Q9R1S7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Abcc6Q9R1S7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Abcc6Q9R1S7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Abcc6Q9R1S7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Abcc6Q9R1S7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Abcc6Q9R1S7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Abcc6Q9R1S7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Abcc6Q9R1S7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Abcc6Q9R1S7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Abcc6Q9R1S7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Abcc6Q9R1S7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Abcc6Q9R1S7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Abcc6Q9R1S7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Abcc6Q9R1S7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Abcc6Q9R1S7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Abcc6Q9R1S7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Abcc6Q9R1S7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Abcc6Q9R1S7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Abcc6Q9R1S7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Abcc6Q9R1S7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Abcc6Q9R1S7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Abcc6Q9R1S7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Abcc6Q9R1S7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Abcc6Q9R1S7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Abcc6Q9R1S7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Abcc6Q9R1S7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Abcc6Q9R1S7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Abcc6Q9R1S7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Abcc6Q9R1S7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Abcc6Q9R1S7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Abcc6Q9R1S7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Abcc6Q9R1S7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Abcc6Q9R1S7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Abcc6Q9R1S7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Abcc6Q9R1S7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Abcc6Q9R1S7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Abcc6Q9R1S7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Abcc6Q9R1S7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Abcc6Q9R1S7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Abcc6Q9R1S7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Abcc6Q9R1S7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Abcc6Q9R1S7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Abcc6Q9R1S7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Abcc6Q9R1S7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Abcc6Q9R1S7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Abcc6Q9R1S7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Abcc6Q9R1S7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Abcc6Q9R1S7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Abcc6Q9R1S7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Abcc6Q9R1S7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Abcc6Q9R1S7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Abcc6Q9R1S7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms