Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slit2Q9R1B9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slit2Q9R1B9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slit2Q9R1B9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Slit2Q9R1B9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slit2Q9R1B9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slit2Q9R1B9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Slit2Q9R1B9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slit2Q9R1B9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Slit2Q9R1B9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Slit2Q9R1B9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Slit2Q9R1B9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Slit2Q9R1B9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Slit2Q9R1B9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slit2Q9R1B9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slit2Q9R1B9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Slit2Q9R1B9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slit2Q9R1B9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slit2Q9R1B9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Slit2Q9R1B9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slit2Q9R1B9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slit2Q9R1B9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slit2Q9R1B9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slit2Q9R1B9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Slit2Q9R1B9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Slit2Q9R1B9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slit2Q9R1B9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Slit2Q9R1B9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slit2Q9R1B9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slit2Q9R1B9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slit2Q9R1B9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Slit2Q9R1B9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slit2Q9R1B9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slit2Q9R1B9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slit2Q9R1B9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slit2Q9R1B9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slit2Q9R1B9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Slit2Q9R1B9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slit2Q9R1B9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slit2Q9R1B9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Slit2Q9R1B9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Slit2Q9R1B9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms