Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc26a4Q9R155 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc26a4Q9R155 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Slc26a4Q9R155 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms