Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Plod3Q9R0E1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Plod3Q9R0E1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Plod3Q9R0E1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms