Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nek3Q9R0A5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nek3Q9R0A5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nek3Q9R0A5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms