Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Npas3Q9QZQ0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Npas3Q9QZQ0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Npas3Q9QZQ0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms