Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE2

Clnk, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClnkQ9QZE2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ClnkQ9QZE2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ClnkQ9QZE2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ClnkQ9QZE2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ClnkQ9QZE2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ClnkQ9QZE2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ClnkQ9QZE2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ClnkQ9QZE2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ClnkQ9QZE2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ClnkQ9QZE2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ClnkQ9QZE2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ClnkQ9QZE2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ClnkQ9QZE2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ClnkQ9QZE2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ClnkQ9QZE2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ClnkQ9QZE2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ClnkQ9QZE2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ClnkQ9QZE2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ClnkQ9QZE2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ClnkQ9QZE2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ClnkQ9QZE2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ClnkQ9QZE2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ClnkQ9QZE2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ClnkQ9QZE2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ClnkQ9QZE2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ClnkQ9QZE2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ClnkQ9QZE2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ClnkQ9QZE2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ClnkQ9QZE2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ClnkQ9QZE2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ClnkQ9QZE2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ClnkQ9QZE2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ClnkQ9QZE2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ClnkQ9QZE2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ClnkQ9QZE2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ClnkQ9QZE2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ClnkQ9QZE2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ClnkQ9QZE2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ClnkQ9QZE2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ClnkQ9QZE2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ClnkQ9QZE2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ClnkQ9QZE2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ClnkQ9QZE2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ClnkQ9QZE2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ClnkQ9QZE2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ClnkQ9QZE2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ClnkQ9QZE2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms