Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChmlQ9QZD5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChmlQ9QZD5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChmlQ9QZD5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ChmlQ9QZD5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChmlQ9QZD5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChmlQ9QZD5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChmlQ9QZD5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChmlQ9QZD5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ChmlQ9QZD5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChmlQ9QZD5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChmlQ9QZD5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChmlQ9QZD5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ChmlQ9QZD5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ChmlQ9QZD5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChmlQ9QZD5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChmlQ9QZD5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChmlQ9QZD5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChmlQ9QZD5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChmlQ9QZD5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChmlQ9QZD5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChmlQ9QZD5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChmlQ9QZD5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ChmlQ9QZD5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChmlQ9QZD5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChmlQ9QZD5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChmlQ9QZD5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChmlQ9QZD5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChmlQ9QZD5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChmlQ9QZD5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ChmlQ9QZD5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChmlQ9QZD5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChmlQ9QZD5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChmlQ9QZD5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChmlQ9QZD5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChmlQ9QZD5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ChmlQ9QZD5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ChmlQ9QZD5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChmlQ9QZD5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChmlQ9QZD5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChmlQ9QZD5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChmlQ9QZD5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ChmlQ9QZD5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChmlQ9QZD5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChmlQ9QZD5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ChmlQ9QZD5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms