Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tnnt3Q9QZ47 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnnt3Q9QZ47 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tnnt3Q9QZ47 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms