Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW9

Slc7a8, Large neutral amino acids transporter small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a8Q9QXW9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc7a8Q9QXW9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc7a8Q9QXW9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc7a8Q9QXW9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc7a8Q9QXW9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc7a8Q9QXW9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc7a8Q9QXW9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc7a8Q9QXW9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc7a8Q9QXW9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc7a8Q9QXW9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc7a8Q9QXW9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc7a8Q9QXW9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc7a8Q9QXW9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc7a8Q9QXW9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc7a8Q9QXW9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc7a8Q9QXW9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc7a8Q9QXW9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc7a8Q9QXW9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc7a8Q9QXW9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc7a8Q9QXW9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc7a8Q9QXW9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc7a8Q9QXW9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc7a8Q9QXW9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc7a8Q9QXW9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc7a8Q9QXW9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc7a8Q9QXW9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc7a8Q9QXW9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc7a8Q9QXW9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc7a8Q9QXW9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Slc7a8Q9QXW9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms