Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Trim44Q9QXA7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim44Q9QXA7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim44Q9QXA7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms