Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tcea2Q9QVN7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tcea2Q9QVN7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tcea2Q9QVN7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms