Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUQ5

Trpc4, Short transient receptor potential channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4Q9QUQ5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc4Q9QUQ5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trpc4Q9QUQ5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trpc4Q9QUQ5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trpc4Q9QUQ5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Trpc4Q9QUQ5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpc4Q9QUQ5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpc4Q9QUQ5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trpc4Q9QUQ5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Trpc4Q9QUQ5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trpc4Q9QUQ5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trpc4Q9QUQ5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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