Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM0

Itga2b, Integrin alpha-IIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga2bQ9QUM0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Itga2bQ9QUM0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Itga2bQ9QUM0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms