Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cdkl2Q9QUK0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cdkl2Q9QUK0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cdkl2Q9QUK0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms