Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdc42ep4Q9JM96 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc42ep4Q9JM96 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdc42ep4Q9JM96 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms