Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Reep6Q9JM62 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Reep6Q9JM62 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms