Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rabgef1Q9JM13 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rabgef1Q9JM13 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rabgef1Q9JM13 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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