Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cabp1Q9JLK7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Cabp1Q9JLK7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cabp1Q9JLK7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cabp1Q9JLK7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Cabp1Q9JLK7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cabp1Q9JLK7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cabp1Q9JLK7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cabp1Q9JLK7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cabp1Q9JLK7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cabp1Q9JLK7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cabp1Q9JLK7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cabp1Q9JLK7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Cabp1Q9JLK7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cabp1Q9JLK7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cabp1Q9JLK7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cabp1Q9JLK7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Cabp1Q9JLK7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Cabp1Q9JLK7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Cabp1Q9JLK7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Cabp1Q9JLK7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Cabp1Q9JLK7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Cabp1Q9JLK7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cabp1Q9JLK7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Cabp1Q9JLK7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cabp1Q9JLK7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cabp1Q9JLK7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cabp1Q9JLK7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cabp1Q9JLK7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Cabp1Q9JLK7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Cabp1Q9JLK7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Cabp1Q9JLK7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cabp1Q9JLK7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cabp1Q9JLK7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cabp1Q9JLK7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cabp1Q9JLK7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cabp1Q9JLK7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cabp1Q9JLK7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Cabp1Q9JLK7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Cabp1Q9JLK7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Cabp1Q9JLK7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Cabp1Q9JLK7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Cabp1Q9JLK7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Cabp1Q9JLK7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Cabp1Q9JLK7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Cabp1Q9JLK7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Cabp1Q9JLK7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Cabp1Q9JLK7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Cabp1Q9JLK7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Cabp1Q9JLK7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cabp1Q9JLK7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Cabp1Q9JLK7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cabp1Q9JLK7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cabp1Q9JLK7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cabp1Q9JLK7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cabp1Q9JLK7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Cabp1Q9JLK7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Cabp1Q9JLK7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Cabp1Q9JLK7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Cabp1Q9JLK7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Cabp1Q9JLK7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Cabp1Q9JLK7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Cabp1Q9JLK7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Cabp1Q9JLK7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Cabp1Q9JLK7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Cabp1Q9JLK7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 235.4 ms